今 祖 師 廟 為 第 三 次 重 建, 始 於 民 國 三 十 六 年 (西 元 1947 年) 農 曆 七 月, 由 本 籍 畫 壇 耆 宿 名 藝 術 家 李 梅 樹 (西 元 1902 - 1983 年) 親 主 其 事; 自 四 十 六 歲 起 至 八 十 二 歲 止, 以 半 生 之 歲 月 為 弘 揚 傳 統 藝 術 文 化 與 繁 榮 桑 梓, 并 追 念 清 水 祖 師 公 之 豐 功 偉 績, 而 規 劃 重 建. 其 結 構 純 以 我 國 傳 統 式 古 法 建 造, 建 築 彫 刻 之 美 聞 名 遐 邇, 故 有 [東 方 藝 術 殿 堂] 之 美 譽.
全 廟 建 築 均 以 精 彫 細 琢, 歷 經 四 十 九 年 尚 未 完 成; 殿 內 之 木 雕, 石 刻, 浮 彫 或 銅 鑄, 無 一 不 是 匠 心 獨 運 鬼 斧 神 工 之 傑 作. 三 峽 祖 師 廟 實 為 一 座 代 表 傳 統 文 化 的 藝 術 館, 亦 可 稱 為 雕 刻 博 物 館,常 年 吸 引 無 數 中 外 遊 客,藝 術 專 家 學 者 及 友 邦 貴 賓 蒞 臨 觀 賞, 歎 為 觀 止.